Американский зоолог, маммолог и орнитолог, ученик Ж. Агассиса (см.), куратор Американского музея естественной истории (1885).
С ламаркистских позиций исследовал влияние климата на географическую изменчивость млекопитающих и птиц. Установил известную экогеографическую закономерность, впоследствии получившую название “правило Аллена”: у гомойотермных животных подвиды одного вида, живущие в регионах с более холодным климатом, обычно имеют более короткие хвосты, уши и конечности, чем у обитателей регионов с более теплым климатом (Allen, 1877a).
Предложил зональную схему районирования суши:
I. Арктическое, или северное кругополярное царство (к северу от границы леса или изотермы 32° F);
II. Североумеренное царство [North Temperate Realm] (между северными границами леса и пальм или 32-70° F) с Североамериканской и Евразиатской областями;
III. Американское тропическое царство;
IV. Индо-Африканское царство с Африканской и Тропическоазиатской областями;
V. Южноамериканское умеренное царство;
VI. Австралийское царство [Australian Realm (Australia, New Guinea, New Zealand)];
VII. Лемурское царство (Мадагаскар) и VIII. Антарктическое, или южное кругополярное царство.
Царства (области первого порядка) подразделяет далее на области и провинции (соответственно области второго и третьего порядков). Исследовал вымирания млекопитающих, в частности американского бизона (Allen, 1877b), и птиц, произошедшие в историческое время на территории Северной Америки.